Lors de la CAN 1996, l’équipe d'Algérie revient en une compétition internationale, et termine ex-aequo avec la Zambie mais s’incline en quarts contre l’Afrique du Sud. Elle ne participa portant pas aux éditions 1998 et 2002 de la Coupe du Monde. De même en 1998, elle termine dernière du groupe A avec trois défaites. En 2000, elle termine deuxième mais s’incline en quarts contre le Cameroun (1-2). En 2002, elle termine dernière du groupe. Ici on veut marquer la différence entre 1990-1996 (période où l’Algérie ne participe à aucune compétition internationale) et 1996-2004 (retour de l’Algérie sur le plan continental). Lors de la CAN 2004, elle s’incline en quarts de finale contre le Maroc sur le score de 3 buts à 1 après prolongation (but d'Abdelmalek Cherrad).